日本时间，4月1日，中午午餐时间，工藤次郎、新野明久和逢坂大河、高须龙儿一起在教室吃便当，工藤次郎说：“因为你们两个一个是不良高须，另一个是掌中老虎，所以就给人的第一感觉可能不一样！”新野明久说：“怪不得全班同学就只有我两个看他们两个呢！”“不是两个，是四个！”正在这时，从教室外走进来的田村麻美和蕾莎对他们说。“因为我们两个也是S M T成员啊！”这时外面又传来一个声音：“还不止，还有我们两个呢！”
这时，大家向外一看，居然是工藤平次和高本樱！“怎么，你们两个是怎么进来的？”“正常啊？走进来的！”“可能没这么简单吧，是不是你对守学校大门的说了什么？”“当然，我们两个就说了一句是来帮其他学校的老师找资料的，所以就进来了！”于是工藤次郎和新野明久露出一副无语的表情说：“这样的点子你们两个也想得出来啊……”“先不说这个，晚上开个会吧！哥哥。”“嗯，你两个就加入我们吧！你们两个负责后勤，等到了晚上开会时来宿舍后面的草丛，我和工藤平次等你们！”“好吧！”“不过，你该赶快出去吧，否则会被追查出问题的！”新野明久说。这时工藤次郎把一沓文件拿给工藤平次，说：“拿这个混过关吧！”于是工藤平次和高本樱向大家道别：“那么我们去了，晚上再说！”
这时，田村麻美对蕾莎说：“他们两个真的是有才啊！”“是啊，真的，你不说我都没发觉！”工藤次郎突然有了一种莫名的感觉……
到了晚上，所有人如约来到了宿舍后面的草丛中，逢坂大河说：“我们来这里做什么？”“工藤次郎于是对大家说，在这里有个秘密基地，就是这个墙角的木门！但是这里不是我们的公会！我们的公会在第十学区，不过从这个秘密基地一下就可以到公会，这个基地我花了很多人手来建立的。不多说了，带你们进来！”
大家一进入这个秘密基地，惊呆了，这里居然有十个宿舍那么长，五个宿舍的宽度，而且内部的所有装备齐全，一进入秘密基地就是会议、成员集合的地方，这里有沙发、茶几、书柜、还有一张特别大的办公桌、上面有一台笔记本电脑，附加一个投影设备。左边有一道门，是武器库，狙击步枪到战术小刀都有。右边也是有一道门，是秘密基地通往公会的唯一的快捷通道。“各位，现在开始开会，会议第一项，先为我们的秘密基地取个名字，大家认为应该叫什么好？原定是‘特别行动战线’！”工藤平次说：“我认为叫‘特别战线部’！”“不行，感觉太别扭了……”新野明久说：“那么叫‘特别小组营’。”“这感觉级别太高了……”“那么叫‘前沿行动小组’。”“连‘特别’‘战线’都不是了……”工藤平次又想了一个：“那么，叫‘死亡战线’。”“想死就直说吧……”这时，高须龙儿提了一个问题说：“为什么不把公会和我们这里拉近距离？”工藤次郎：“公会可是要有保密性质的，毕竟那是我们提供装备的地方啊！”工藤平次说：“是啊，要是被发现了还得了！给你看看！”于是工藤平次打开右边那扇门。高须龙儿惊讶：“三道门！”“是啊，三道门里有一道是正确的，而且正确的那一道门里还有三道门，同样要找到正确的门后又有三道门，如此连续六次才能到达通往公会的轨道车上！但是如果你开错了门，那么你就会走出这个秘密基地，一直这样持续下去！同时那间房也会自动旋转，当然也可以手动，除非你打开正确的门。”“真厉害！”工藤次郎说：“当然了，不厉害怎么能叫保密措施啊！不过不用担心走错门的问题，有本……呃，刚才说到什么了？”工藤平次回复：“保密战线。”“嗯，对！有本保密战线的老大在这里……”结果，工藤平次被工藤次郎一脚从天窗踢飞出去……
“算了，还是原计划，叫‘特别行动战线’好了。在这里还是安全的，在旁边的宿舍墙上我安装了一个高科技摄像头，可以当作侦察机使用，同时自身有防御性，所以有陌生人靠近这个基地出入口都会被困住！”“做的好像军事基地一样啊……”
过了很长一会儿，其他人都回去宿舍去睡觉了。但是工藤次郎却没有，他在特别行动战线的作战室里拿着超能力狙击炮，并且还全副武装！不用说，你也知道的！工藤05001对工藤次郎下达挑战书，而且是一个对战二十个，还有武器！根本不想参加「实验」没办法了，工藤次郎只能去看看了！
在另一边，白发少年一方通行和神秘少女最后之作正在散步。虽说是散步，但是他们实际是要回到宿舍里。他们走着走着，看到了工藤次郎背着一包什么东西正在跑。这时，最后之作说：“那是……工藤次郎吧？御坂御坂觉得很奇怪的问道。”一方通行说：“确实是，但是他要去干什么？走，跟上去看看！”与此同时，御坂10032号也看到了工藤次郎背着什么东西跑，于是她立即通知了正在书店里看书的御坂美琴和在宿舍里看电视的上条当麻，并没有人让她去说的，是她自己自作主张。毕竟她觉得可能有什么事情要发生！于是上条当麻、御坂美琴、御坂10032号一起向着工藤次郎的方向去，原本正在暗中跟随工藤次郎的一方通行看到他们非常着急的跑过去，于是他们也不掩藏了。立即去追上上条当麻问清是什么状况！上条当麻看到一方通行他们过来询问，上条当麻说：“自从上次的公园事件后，他们三个人都有了能力，但是唯独只有工藤次郎的反应不一样。自从开学之后我就总感觉他有点不对劲了。”“是吗？御坂御坂问道。但是，御坂御坂我感觉这个事可能不会有那么简单的……”话音刚落，只听见在附近的一个废弃工厂里传出一声巨响！御坂美琴说：“快，看来一定是他们开始打起来了！”“快去看看！”
在废弃工厂里，工藤次郎对工藤05001说：“为什么之前一次性上了5000个人，这次却20人来围攻我一个！”“很简单，之前的5000个是为了你的工藤10000号——终极复制的进化！”“那么在那一天我听到的‘在之后再次生产49个’是什么意思？”“我们没有详细数据，所以无法告诉你正确的答案！”“哦，是吗！那么你先来对阵我吗？”“暂时没有那个必要！”“为什么？”“因为现在面对的是真正的LV6——绝对能力者！”工藤次郎想：难道说……之前的那场「实验」很明显不是我干的！“我想你现在应该知道了吧！”“哼，当然。”“那么开始吧，首先是05002的表演……”轰——
此时，上条当麻、一方通行等人来到了工厂大门，但是大门却是关闭的！而且从外面上了锁！一方通行说：“不用担心，我来搞定！”一方通行于是利用「反射」把大门破坏了！上条一行人于是冲了进去！只见工厂里到处是灰尘，而且还有厂房倒塌后的废墟。不远处不时传来脚步声，这个脚步声不是一两个人，而是很多！上条当麻他们躲在一个箱子后面。这时，只听见工藤次郎说：“哼哼，05002，你的能力等级有点特殊啊，到底是不是应该评定为LV5？但是，你要知道LV5是伤害不了我的！但是为了尊重你，我只好这么做了。”这时工藤次郎并不知道在附近有一些他认识的人正在观望。只见工藤次郎走向一边，去拿他刚才背的背包。这时05002说：“难道，这个包里面是……”“没错，这个包里面就是这个专属于LV6的特殊用途大型轻狙击步枪——超能力狙击炮！”
工藤次郎拉开包的拉链，把包一扔，只见工藤次郎手中出现了一把银白色的大型步枪。这把枪聚集了七名LV5之中六名的超能力。只见工藤次郎对准了工藤05002号，咚——的一声，子弹飞了出去，工藤次郎05002号被打飞了出去。就在这时，其他的工藤复制品就像是受到了控制一样，一个个都向工藤次郎冲了过来！“咳~没办法了，只能用我的能力了！”于是工藤次郎在旁边的空地上拿起了一个特别长的钢管，复制出来许多钢管，并且扔向其他19个工藤复制品。在箱子后面的上条当麻感觉这个「实验」不只是这么简单，于是对一方通行说：“你注意地面有没有东西。”然后又对御坂美琴说：“你注意着空中有没有空降的东西，因为我感觉这件事不只是这么简单！”话音刚落，天上传来一阵飞机的轰鸣声，工厂外也来了很多的装甲运兵车。不一会，天上、地下全都是工藤复制品的身影，至少上万人……
上条当麻说：“走，我们冲出去去找工藤次郎！”一方通行说：“哼，荣幸之至！”这时，御坂美琴一边放电一边说：“那么你们两个还要在这里等到什么时候啊？还不快去！”最后之作说：“我和10032号在这里等你们……”这时，御坂妹妹10032号貌似看到了什么东西一直看着天上。“怎么了？——御坂御坂不解的问道。”“没怎么，只是觉得有一架无人侦察机飞了过来！——御坂说道。因为御坂感觉到一个类似于无人机的电波，所以这样推断！——御坂解释道。”这时，只听见周围突然安静下来。御坂美琴、上条当麻和一方通行找了一个开着门的箱子躲了起来。他们三人距离工藤次郎非常的近，也没有听到周围有任何打斗的声音。上条当麻说：“我们是不是被发现了。”御坂美琴说：“不可能！要是被发现的话早就应该发现了……”这时，只听见工藤次郎说：“全部人都趴下，暂停实验！有无人侦察机！”上条当麻通过箱子上的小孔向工藤次郎看去，只见工藤次郎用绳子把铁棒系在身上，拿出来一个黑色的小型笔记本。这时，只听见工藤次郎说了一些奇怪的话：“五行合一，土和水为其构筑之物，木为其之形，金为其之面，火为其融合之物。铸成神之剑，消灭来犯者！”这时，上条当麻说：“这，工藤次郎居然是……”
在学生宿舍，正在上条当麻宿舍里睡得正香的茵蒂克丝翻了一个身，醒了过来。“嗯~当麻……咦，当麻呢？”于是茵蒂克丝在宿舍里找来找去，但是都没有看见上条当麻，可惜手机正在充着电。她猜可能是在旁边的土御门元春的宿舍吧，于是来到土御门元春的宿舍，敲了下门。这时，土御门元春来到门口开了门，看到茵蒂克丝，说：“啊，这么晚了有什么事吗？”“呃，那个，当麻在吗？”“你说阿上啊，他没有在我这里啊！”“那么当麻去哪里了啊？”这时，茵蒂克丝又想起了同样是住在旁边的工藤次郎的宿舍。茵蒂克丝同样也是敲了下门，工藤平次来开了门，说：“你好，请问你找谁？”“那个，当麻在吗？”“上条当麻？没在我这里啊！等一下，我叫我哥哥打个电话给他……咦，哥哥呢？”这时的工藤平次也才发现工藤次郎不在宿舍里！后面的土御门元春说：“怎么了吗？”工藤平次说：“我哥哥和上条当麻不见了！”土御门说：“会不会在新野明久这里？”“对哦，我敲敲门看看。”过了一会后。“也是没人……”“他们三个是怎么了？怎么没有在宿舍里。”
这时，高本樱、田村麻美和那位专业魔法师蕾莎听到动静后向楼上看，只见土御门元春、茵蒂克丝、工藤平次三人在楼上说什么。于是也上楼来了，而且也把逢坂大河与高须龙儿也引来了。而现在，在晚上八点在学生宿舍的八楼（顶楼）上有八名学生说了八种他们预测的可能性。但是，工藤平次想了一下说：“我突然想起来，还有一个！就是在上次的那个道路神秘毁灭事件，我打个电话给新野明久看能不能联系到哥哥，顺便再问问他在哪里！”
过了一会儿……“居然打不通，关机！”茵蒂克丝说：“真是的，他们在干什么值得这么重要而又保密的事啊……咦？”“怎么了？”工藤平次问。“有魔法出现，而且距离我们很近！跟我来！”这时，专业魔法师蕾莎也察觉到这是一种极其特别的魔法，于是补充了一句：“这是‘五行剑’，大家要注意啊！”这时，听到「五行剑」的工藤平次明白了什么，之前的还十分紧张的表情没有了！但是他依然还是跟着去看看。
此时，在废弃工厂，消灭了一个小型无人机后，工藤次郎根本还没有反应过来就又来了几架，而且还带着轻型航空炮以及小型导弹（一个灯泡大）。于是，工藤次郎又用了另外一招——土行盾挡住了无人机的进攻，然后，只见工藤05200拿起工藤次郎丢在后面的超能力狙击炮，对准了工藤次郎！工藤次郎听到动静，转过身来。这时工藤05200正好开枪，打中了其中两架无人机。幸好没有打中，否则七名超能力者的结合是工藤次郎斗不过的，绝对必死无疑！这时在废弃工厂门口的茵蒂克丝他们看到了最后之作，于是跑向她，御坂10032号立即示意他们蹲下来。茵蒂克丝他们立即蹲下来，这时走过去两个工藤复制品。后来的人都惊呆了，工藤次郎说：“怎么会这样！”“最后之作说：“这时你的哥哥的「实验」，应该是与LV6有关，但是他们说的「终极复制」是什么我就不知道了。”
正好上条当麻回来了，上条当麻说：“工藤次郎他……他……”工藤平次说：“他怎么了？”“他居然是一个魔法师！”这时，除了工藤平次之外的人都震惊了。
大家好，我是作者工藤次郎，这篇小说主要讲述了学园都市的三名新入生的他们身边的故事，以及之后发生的大战！而本章讲述了工藤次郎在第二场大规模的【实验】之中暴露了自己的真实身份——中国的魔法师！但是谁是拯救了工藤次郎的心结的人呢？敬请期待下一章！
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