顺治四年六月底，满清大军忽然停住了脚步，西线孔有德与吴三桂只是渡过黄河便没了动静，东线尚可喜一城未下，死死卡在河南山东交界处，也是没了动静，所有人都在猜测顺治的意图，可是帝王心难测，哪怕他只有十一岁，总之没人猜的透顺治的想法。
顺治四年七月初一，明朝这边发生了大事，那太子一系官员不满现状，纠集几个各部三品以上高官，弹劾马士英‘故意空置乾清宫，欲以首辅之名行天子之事’，那弹章马士英没有封锁住，泄露了出去，一时间民怨沸腾，随后好似为了呼应这沸腾的民怨，南直隶各粮铺主持了罢市，中枢本想强制开市，可某些官员一句‘不可与民争利，此乃太祖之言’，搞的有心解决事态的官员投鼠忌器，随后呢，十余日无粮可买的百姓愤怒了。
故而，七月中旬，在有心人的诱导下爆发了民乱！马士英与其他官员协商以后，趁着暴乱规模尚还可控，便由户部主持开仓放粮，同时强硬派出兵马司查封恶意领头罢市的粮铺，仅一日，粮米供应恢复正常，民乱随之瓦解。马士英敏锐的从这次动乱中发现了些许蛛丝马迹，于是被查封的粮铺经过甄别，放过了很大一部分，但有几个大粮铺却是被打击的很惨，而这几个大粮铺，都是晋商所开。
七月底，弹劾马士英的官员被查出收受巨额贿赂，于是这些官员纷纷落马，眼看潞王一系即将取得胜利，太子系官员开始反击，首先是有人举报大理寺卿私藏兵器豢养死士，“查实”之后大理寺卿不甘的交上了辞呈。然后是礼部左侍郎遭到弹劾，这次太子系弹药不足，礼部左侍郎仅仅只是在家呆了两天而已。最后是兵部左侍郎遭到大量弹劾，这次太子系准备充足，根本没有给人辩驳的余地，无奈的递交了辞呈。
当然，马士英不可能不还手，他忍耐着只是为了揪出真正的幕后之人，几次针对高官的进攻让他锁定了几个核心官员，正欲下死手，事情却出了变故。潞王遭到刺杀，昏迷不醒，随后大量官员提请太子立刻继位。
大行皇帝朱由崧被刺去世不久，又有刺杀皇储的事件发生，这件事震惊朝野，刺杀弘光那件事已经抓了杀了很多人了，可那些刺客好像根本没受影响，要知道，为了保护潞王，已经安排了很多人手，可竟然还是被得逞了，于是马士英意识到，他们阵营中一定有内鬼。
但不管怎么说，昏迷的潞王已经失去了竞争力，现在的情况要么马士英服软，迎那个身份极其可疑的“朱慈烺”入主紫禁城，要么，就是脱离朝堂斗争，用真刀真枪来争夺对这个皇位的安排之权，可，马士英犹豫了，目前他在明，那不知所谓的敌人在暗处，想大开杀戒也不知该杀谁，局势便僵持住了。
不过，八月初三，锦衣卫指挥使收到了不知何处而来的消息，说前福王潜邸的老太监便是设计刺杀弘光的主谋，马士英听闻喜形于色，随后便是展开搜捕，于八月初七，在南京城一处偏僻宅子里生擒了这老太监，经过两日拷问，骨头很硬的老太监还是招了，据他所说，他只知道有人需要他帮助，而他与弘光有着血海深仇，参与刺杀是为了报仇，不过具体什么仇就不说了，以弘光这德行什么事都做得出来。若是所说属实，那么这老太监也不过是个马前卒，他的任务就是安排乾清宫的值班表，然后就是追杀弘光，其他的都与他无关，于是线索就断在这里了。
不耐烦的马士英又出手了，他以极其强硬的姿态，把几个山西籍的高官赶出了朝堂，用的还是老套路，弹劾他们收受巨额贿赂，很快明面上的晋党官场势力已经被全部清理了，可暗处的，马士英是完全没办法，只能说幸好他和刘孔昭掌握着南直隶最强大的武装力量，不然乱子更大，最后便是囚禁“朱慈烺”，等候潞王醒来，至此，明朝内部的斗争算是短暂的结束了，其结果便是潞王系大获全胜。
但是，他们哪里是大获全胜，刺杀潞王的人没找到，潞王还昏迷不醒，更可气的是，这些人藏的太深了，一点痕迹都找不到，总不能把所有山西人抓来问吧？毕竟坏人只不过是少数，大多数人要么是被裹挟，要么就是被威胁，如果不抓出那有能力串联这么多人的幕后之人，那就不算是胜利。
明朝内部斗得很凶，而山东战场却是打的更凶，扬州副总兵程旭如疯了似的，追着尚可喜一路猛打，尚可喜本来只准备在这山东边上守着，可那程旭完全不讲道理！这场战斗是与明朝内乱同时进行的。
在七月底，程旭带着两个袁继咸安排的参将，进入山东地界，进入山东的程旭一直没有进攻，他领着些骑兵跑遍了整个山东。
八月初一，程旭开始进攻尚可喜放在山东西边的部队，激战一日，此部不敌，败退河南，尚可喜见情况不对，害怕被分割包围，于是收缩防线，程旭成乘胜追击，于归德府附近遭遇尚可喜主力，双方大打出手，激战至八月初三，却是难分伯仲。
八月十日，程旭递交新的进攻计划，曰破釜沉舟，欲集合整个山东的守备力量，即唐通和黄得功部，对尚可喜发动一次大规模的强袭，计划中由黄得功正面强攻，唐通、程旭迂回穿插至北直隶于河南交界，切断尚可喜退路，再由唐通挡住北直隶来援，程旭南下与黄得功合击尚可喜，程旭还在计划中补充，说此战目的在于彻底打垮尚可喜，所以一切都以斩首行动或者歼灭敌人核心部队为先，袁继咸接到计划于当天便直接批准。
八月十二日，唐通离开驻地与程旭汇合，两部合骑兵五千，步卒三万，从山东西北部进入河南。与此同时，从十一日开始便与尚可喜对峙的黄得功发起进攻，当然，按计划此时是试探性进攻。
八月十四日，黄得功按原计划继续试探，唐通抵达指定位置设立防线，程旭领全部骑兵南下赶赴战场。
八月十五日，中秋节不会影响计划的实施，尚可喜敏锐察觉到有人迂回身后，但面对黄得功的进攻他不敢轻易变阵，只是加固了身后防线，午时黄得功按照计划，发起总攻，程旭此时早已在附近观察，发现尚可喜有了防备，于是果断加入正面战场。而唐通与北直隶而来的援军交战，按计划，他只需要守最多三日。
八月十六日，尚可喜被击败，狼狈向南逃窜，欲找开封附近援军支援，却被程旭衔尾追杀，数次被击溃，最后程旭军体力粮草耗尽，选择撤离。而尚可喜只带着最后几百亲兵逃到了开封。
八月十八日，满清援军知道尚可喜已经战败，顺治随即下令退回北直隶，于是河南的东半地区宣告易主。战役到此应该就算结束了，程旭有些莫名的申请留在河南，这项提议自然无人否决，毕竟河南离北直隶太近了。
得知战况的顺治让吴三桂率军入河南，令吴三桂驱逐河南境内敌军，也就是说吴三桂要和程旭交手了，不过出乎意料的是，程旭与吴三桂似有默契，两人虽频频交手，但每次都只是点到即止，两人基本没付出多少伤亡，当然，这些只有他们俩知道，其他人得到的战报是程旭天天与吴三桂交战，战果寥寥，损失惨重，吴三桂亦然。
这场战役中，程旭是最大的赢家，成功的占据了一块地，还与侵攻而来的敌军将领有默契，这让程旭得到了难得的恢复期，此外程旭还因功升为总兵，驻守归德府，程旭名正言顺的把握机会，私下里想办法控制归德府地区并大肆扩军。
那顺治这近乎放弃河南东部与山东的决策有何意义？他到底在干什么呢？也不是什么难以理解的事儿，他在操纵晋商动摇明朝局势，把间谍全都送到了南直隶，这便导致没有多余的侦查间谍去往山东，缺乏情报的顺治反应自然慢上不少。有人劝说河南丢不得，但顺治一意孤行，非要先对明朝中枢进行一系列的打击，其结果便是，顺治失策了，他低估了马士英，总而言之，这场虎头蛇尾的战役还是结束了。
在这段时间里，明朝看似取得了优势，但事实上损失惨重，长期的皇位空置让百姓对中枢渐渐失去信心，由此导致了大量百姓北逃，而明朝军队此战中虽说取得胜利，可各部队都不过堪堪保持着完整建制，至少半年内无力进行大的军事行动，相较而言，满清的损失却远远算不上伤筋动骨，不过是面子上不太好看罢了，如此态势下，明朝，显得有些风雨飘摇。
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