21世纪末，由于人类一昧的浪费资源破坏环境，加上被毫无根据的主义主张所怂恿而互相残杀，终究到了面临 灭亡的困境。为了避免灭亡，他们所作的选择是利用基因 操作，采取强制性的进化方法，预先准备程式而从 DNA产 出生命，连性格和适应能力都能掌控。由于人们丧失了恋爱、感情和支配欲，社会因此相当安定，一直到了23世纪 ，终于确立了完整的基因操作社会……
生化科技基因复制人圣堂美香、苏菲亚、蜜尔、玛利 欧与血姬等五人，被选为“比尔基斯战舰”S任务的成员 ，由舰长天际博人领导。这五人各有不同的基因组合和特 殊技能，其中人称白雪女王的蜜尔拥有本世纪最完美的技 能，也因此相当狂傲自大，总是认为尖端新武器“尖锋号 ”的驾驶非她莫属。另一方面，由于马拉坎纳太空站的爆 炸直接冲击了北美加州，美香的母亲也因此生死未卜……
骄傲的蜜尔虽然自认是尖锋号理所当然的驾驶人选， 但由于尖锋号的最新程式还没完成，因此没人肯当试验品 上去试驾并顺便修改程式，所幸美香自告奋勇担任这项任 务，并由苏菲亚担任副驾驶，目标是消灭火圈轮环。然而 ，这个程式在任务一开始时就因瑕疵而当机，美香与苏菲 亚差点就丧命宇宙……
塞尔吉擅自下令比尔斯基号脱离军方的管辖，目的是 消灭对地球发动攻击的轮环。为了彻底调查利用轮环攻击 人类的元凶“欧贝拉斯”，比尔基斯号来到了木星的卫星 “诳圻戋o”空域，不料轮环竟突然出现并包围了诳圻 得整个星体，舰长天际博人随即下令美香和苏菲亚出动尖 锋号冲撞轮环，然而美香却认为这根本是叫她去送死，因 而执意抗命……
为了修复老是当机的尖峰号，人类最厉害的程式设计 师佐藤朵倩登场了，朵倩的代号是“娃娃天使”，手里永 远抱着一个会说话人偶娃娃。正当整修尖锋号瑕疵的工作 如火如荼地进行时，一个小型的轮环却潜入了比尔基斯战 舰，它不但复制出假冒的舰上人员、释放病毒入侵舰内的 电脑系统，使得舰上顿时陷入一片混乱，最后还夺走了尖 锋号……
航行于外太空的比尔基斯号，回收了一艘漂浮于太空中的21世纪小型太空船，该船搭载了三名来自于21世纪的男子，据说他们是在返回地球的途中遭遇到了轮环，随后便来到了23世 纪。天际舰长虽然将他们以古代人的身份予以隔离，但是美香和苏菲亚却因为好奇心的驱使 ，马上就跟他们成为好朋友，并告诉他们关于现在这个基因操作世界的一切；然而，这些男人在得知世界变成如此后十分愤怒，因而占据比尔基斯号并要求返回地球……
美香驾驶着尖峰号准备向轮环展开攻击，不 料当目标进入射程范围时，尖峰号竟然又当机 了，就在美香打算重新启动系统时，却发现尖峰号出现异常的状况。就在此时，比尔基斯号直接被轮环击中，天际舰长在混乱中失去了意识，玛利欧随即接下指挥权并设法逃离轮环的攻击。另一方面，担任副驾驶的蜜尔强制解除了美香的 DU(DEVICE UNIT)，打算自行重新启 动尖峰号，但这时她才发现，尖峰号竟然被安装了前所未见的攻击程式……
蜜尔的记录员蕊咪竟然是**组织的成员，其组织的宗旨就是反对政府以操作DNA的方式制造人类，而更令人意外的是，史尼克卿（塞尔吉）居然也和蕊咪同一阵线，这使得蜜尔大为震惊。蕊咪在诳圻戋o卫星的尼本基地发现另一艘尖锋号，在看过其黑盒子的资料后才知道，政府、元老院以及**组织都被史尼克卿骗了，原来史尼克卿的真正目的是要把地球和人类全都消灭……
由于比尔基斯舰的擅自行动，政府终于下令联合舰队出动追击。联合舰队的女司令官是玛利欧的旧识娜达莉，娜达莉念在旧交情以及对玛利欧的了解，于是决定给玛利欧一点时间考虑，并希望他能交出比尔基斯舰和尖锋号。然而，娜达莉旗下第一级战斗舰“约纪”的舰长约翰杰特，突然擅自对比尔基斯舰发动质子导弹攻击，不料却误射了娜达莉的旗舰，娜达莉因此生死不明……
约翰在击沈联合舰队司令官娜达莉的旗舰后，便自己坐上了司令官的宝座，开始对比尔基斯舰发动攻击。由于约翰所散播的病毒奏效，比尔基斯舰失去控制渐渐被木星的强大重力所吸引。在此生死存亡之际，蜜尔不经意的从尖峰号上发现了空间转换程式，并迅速将它完成了，玛利欧遂利用此程式将自己瞬间传送到约翰所在的约纪舰上，打算一枪将约翰毙命好结束这场战斗……
玛利欧在侵入约纪舰后不久，其生命迹象的讯号便消失了，这个噩耗使得比尔基斯舰上所有的人震惊不已。舰长卧病在床、副舰长阵亡，比尔基斯舰上瞬时陷入群龙无首的状态，岂料轮环又在此时来袭，记录员贝特李查于是毅然扛起指挥官的重任，号令全舰开始对付轮环。美香和苏菲亚驾驶尖锋号出击，然而朵倩所完成的尖峰号最终程式却出了状况，导致美香在攻击轮环时突然昏了过去……
蕊咪死了，蘇菲亚死了，玛利欧也死了。舰长天际博人终於醒了，面对这种存亡关头，舰长立刻下令美香出动尖锋号，然而美香却执意不肯，登录员贝特李查也认为不必再做无谓的牺牲。为了拯救人类的生存，虚弱而恍惚的博人只好自行启动尖峰号的传送器，打算在抵达木星的第二卫星尤罗芭後，启动质子崩坏弹与尤罗芭同归於尽。美香随後也急赴尤罗芭想救回博人，但是……
美香驾驶尖锋号前往木星第二卫星尤罗芭拯救舰长天际博人，途中遇到同是驾驶尖锋号的蜜尔前来阻拦，展开一场尖锋号对决大战。此时，天际舰长在尤罗芭和塞尔吉也展开一场枪战，然而塞尔吉是不朽之人，拥有迅速的细胞再生能力，天际舰长根本杀不了他。就在紧急关头，美香驾驶朵倩修改过的人性化尖锋号降落尤罗芭，拥有白色基因类型，被视为最具可能性的美香要如何拯救人类呢?
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