（Stage03：兵工厂）
Zero：“这些是…？！”（地上横七竖八地躺着工作人员的尸体）
雪儿：“兵工厂中发生重大骚乱，看样子，是异常者造成的吧，请尽快平息骚乱吧，拜托了。”（Mission Start）
（来到中BOSS房间中）
系统音：“警报！警报！发现入侵者！发现入侵者！”
Zero：“！”
雪儿：“Zero，看来有人已经篡改了兵工厂自我防御系统当中的敌我判别机制！”
Zero：“什么？！”
雪儿：“我们已经追踪到那家伙的运动轨迹了，就在前方！”
Zero：“在此之前，就让我将兵工厂的自我防御系统关闭吧！”
（与中BOSS，控制电脑战斗，战斗结束后）
系统音：“自我防御系统已关闭。”
（继续前进，来到BOSS房间中）
Zero：“引发骚乱的家伙，受死吧！”
？：“我还以为，你已经被当作入侵者被这个兵工厂的自我防御系统摧毁了呢，看来我失算了啊。我好不容易才篡改了自我防御系统的敌我判别机制，将这里的一切工作人员都当作闯入者处理掉，让这座兵工厂为我，哦不，为ModelV而服务。”
Zero：“又是ModelV…”
雷霆獬豸：“为了扩张我们的实力，我们需要强大的武器装备去改变世界，但在那之前，我雷霆獬豸，要把你大卸八块，然后用你身上的螺丝和零件组装为我们的武器装备！”（WARNING）
（若被他打败）
雷霆獬豸：“马上，我们就有更加强大的武器装备了，但在那之前，绝对不容许它发生短路，这么说来，你的零件和螺丝就没用了吧，就让这些零件和螺丝当作废品处理掉吧！”
（打败他后）
雷霆獬豸：“不、不可能…你明明已经短路了…还能释放出如此强大的能量……这、这就是……我们所追求的……威力吗……呜啊啊啊啊啊——！！！！！！！！！！！！”（大爆炸，Zero被传送回基地，Mission Complete）
（打败雷霆獬豸后，获得他的EX技：宙斯雷）
（回总部后，发生剧情动画）
雪儿：“辛苦你了，Zero。那座兵工厂的情况已经基本稳定了，虽然设施被破坏了不少，但是，会慢慢恢复的。还有，被篡改的自我防御系统也已修复，部分线路正在抢修，不过已经没事了。”
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