龙之谷的故事发生在一片名为阿尔特里亚（也有称阿尔切林加）的大陆上。传说众神之王德斯莫德乌斯命他的两个女儿阿尔泰亚（阿尔特里亚）和维斯提内（迷之大陆）分别创造世界。但是德斯莫德乌斯却只称赞了阿尔泰亚所创造的世界，维斯提内非常嫉妒，于是就用计让阿尔泰亚服下一种非常可怕的堕落之毒。随后事情败露，维斯提内逃往了自己创造的世界，阿尔泰亚为了保命只能陷入沉睡。在她睡去后，她的梦境慢慢的覆盖了阿尔特里亚，形成了现在的世界。
一日，来自迷之大陆的暗影龙入侵了阿尔特里亚。阿尔特里亚上的两条守护巨龙，古代龙和混沌龙奋起应击。虽然成功杀死了暗影龙，但是混沌龙受到暗影龙血液的污染而堕落，古代龙不得已杀死了它，混沌龙的宝玉被分成数块散落，古代龙用尽气力，将体内宝玉一份为二了。
这次大战虽然避免了迷之大陆堕落之毒的入侵，但也只是暂时的阻止，堕落之毒已经深入混沌龙那碎裂的宝玉之中。
但是不久，一部分古代人，也就是当时的人类，进行了一场可怕的实验，他们从迷之大陆试图召唤维斯提内。并且仿照暗影龙知道了它的复制体，黑龙。黑龙的出现再次让阿尔特里亚陷入危机。正在这为难时，古代人的首领，贤者阿罗诺与黑龙大战，并最终击败了黑龙，将其打伤。世界暂时安全了，但并不是永远安全，黑暗随时注视着这个世界，等待机会，便再次归来。
黑龙由于被贤者打成了重伤，于是花费很长时间来治疗，伤势痊愈的黑龙继续四处横行，世界再次遇到了危机。在黑龙的猛攻之下，仍有一些人类的后裔幸存了下来，坚守着自己的文明。但是黑龙的威胁越来越大。精灵们为了将世界，从黑龙的威胁中拯救出来，再次和断交已久的人类王国建交。包括特使弓箭手奈尔文、魔法师卡拉秋、战士巴尔纳、牧师特拉玛依和贝斯柯德成为了屠龙者的领袖。而率领这些人的，是一个拥有精湛的剑术和俊秀外貌的金发剑士，名叫杰兰特。
他们参加了龙之突袭，并最终打倒了黑龙。但是在战斗中，贝思柯德战死（实际上他是敌人卧底，并没有死），奈尔文和卡拉秋患上了无法恢复的后遗症。特拉玛依突然回到了神圣天堂，而杰兰特则失去了消息。失去领袖的屠龙者们，也全都四散到了各地。但是有关龙之突袭的传说，却流传了下来，至今还让众多冒险家和诗人们津津乐道。
大约10多年前，在大陆的北部，出现了耀眼的星星。那是预示着贤者预言中的“先知”出现的星星。在大陆北部，有一家人在躲避魔物的追逐和世人的眼光。谁也不知道他们一家最后到底怎么样了。
但是不久之前，贤者预言的第二颗星星“太初之星”出现了。知道贤者的预言的人们，期待着先知能够降临，来拯救这个世界。但不知道为什么，和他们的期待相反，魔物们开始变得更加凶恶。在人们的不安之中，神圣天堂有一位牧师，秘密地踏上了前往魔法山脊的旅程。
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