故事发生在距现在不远的未来我们人类所了解的世界表面看上去并未发生太大变化但是世界各地不断传来『太空野兽Space Beasts异生兽』攻击吞食人类致使人员伤亡报告.
为了暗中解决这个问题人类政府秘密联合成立了世界性防卫组织『Terrestrial Liberation Trust国际解放机构』总部位于北美简称『TLT』其下日本支部被称为『TLT—J』.而『TLT—J第三基地:自由堡垒』直属特种机动作战部队就是『夜袭队NR（Night Raider）』他们的任务就是秘密消灭日本境内关东地区的所有『异生兽』而组织对于所有目击『异生兽』的幸存者则会消除他们的记忆在黑暗中维护人类社会秩序.
但随着敌人『异生兽』的不断学习进化致使拥有骄人战绩的『夜袭队』陷入苦战.但『光之巨人Ultraman Nexus奈克赛斯奥特战士』突然登场并打破了这种僵局作为『奈克赛斯奥特战士』的『适能者Dunamist』[姬矢准]出现在这场人类与『异生兽』的战斗之中他利用相位的褶曲制造出属于自己的战斗空间『美塔领域Meta Field』在变身巨大化后将『异生兽』拉入这个与世隔绝的异空间内进行战斗.在面对新型战场环境下『TLT』研发出的特殊科技战机合体后也可进入本空间内进行作战.
『TLT—J第三基地:自由堡垒』『夜袭队』的新队员[孤门一辉]与[和仓]队长及其他队员一起处理着繁忙作战任务.可自从他遇到[姬矢准]后便对自己任务及周围环境产生疑问.
组织内究竟隐藏着怎样的秘密?队员们的过去又是如何?『奈克赛斯奥特战士』和『异生兽』的原形到底是什么?这一切事件的根源又是……?
[孤门]和[姬矢]在不知不觉地不断接触中建立深厚的友谊并一步步开始揭开这一切现实中的谜底……
在这里个人的恋情犹如花朵般脆弱只需空荡残破的现实放在眼前一切都会随之凋零.这里没有什么甜美的爱情故事只有黑暗的人性现实一切皆为空虚唯有死神等待黑暗才是人心中最可怕的隐藏者……
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