公元2035年，这是一场海上争夺的开始。
4月20日，E国新型战舰卡亚号第一次下水试航，它将环绕E国海上领域作为武力威慑，在下水三个小时之后，E国国防部部门失去对卡亚号战舰的联络。次日早上九点，打捞部队发现已经被击沉的卡亚号战舰，无人员生还，也没有留下任何证据推测。由于卡亚号受战舰损严重，失去回收价值，E国不得不放弃打捞卡亚号战舰，宣布此次试航彻底失败。
6月7日，据统计，自第一次E国卡亚号被袭击开始，各国已知公布受害船只已经高达60艘，其中不限于普通商船，军事战舰，观光游轮等。距统计结束之后，受害数量还在激增，受害船共同的特点都是无人员生还，直接被击沉海底。
7月4日，联合国成立调查小组，试图寻找该恐怖组织的踪迹，但由于U国等国家的干扰，进度缓慢。
9月17日，联合国终于利用卫星系统拍摄到袭击者的身影，虽然精确度很低，但依稀可以辨认出是装备炮台的女性人形武器，除此之外再无有用消息。
..10月16日，大西洋海域海面上突然出现大量女性人形未知生物，它们能行走于水面上，攻击力强悍，强行攻打部分国家的海防基地。
10月17日，身为代表人的深海战舰大和第一次直接出现在人类视野中，宣布往日袭击都是深海所谓，从此以后人类必须离开大海，大海将是它们的天下。
那一天，人类失去了大海，大海失去了自由。
又一次的，人类进入了隔绝时代。
2036年11月24日，经过各国努力，科学家终于从深海中提取出成型因子，这一成果让人类明白深海战舰的形成。成型因子的提取成功让人类也开始妄图获得同等力量。为此，人类开始回收二战时期沉没的战舰进行修复和注射成型因子，创造出拥有思维，与深海战力相等且听从人类的舰娘。
但很快政府发现事实并没有他们想象的那么美好。在战斗中舰娘常常会发生强制休眠，火力失常，对部署反应迟钝影响战机等无法容忍的缺陷。这一现象的大量出现使得上层社会强烈怀疑自身的投入是否能获得满意的回报。
2037年2月3日，一名名为企宣的新兵成功指挥舰娘阻止了一次深海突袭并进行小范围的反击。这是人类历史上第一次舰娘无不良反应的战役。
2037年7月11日，科学家在企宣身上发现一种可以组成卡塞亚性状的多组基因（性状什么的凑合看一下即可，这里我学的不是很好）。它能使个人放射一种独有的脑电波，正常情况下是对生物无害的，几乎可以忽略不计。但它却可以启动舰娘机能，保证舰装的正常运行。
同年8月1日，军事总督府因此成立，召集拥有卡塞亚性状的人类进行培训，送往前线进行指挥，而这些人也被称作提督。
人类的反击战，就此开始。
公元2040年，总督府决定对深海进行闪电战术快速而有力的重创深海。为了战术的成功，总督府并未对外界进行声明，并以前线提督为诱饵，引诱深海进入圈套，进行成功打击。这一战役的成功实行，使深海受到有史以来最大重创，深海战舰大和深受重伤，但在被击沉的过程中被一艘驱逐舰强行救走。
但这并不妨碍深海的畏惧，在很长一段时间内海面上获得难得的平静，社会甚至故意性的遗忘提督们对这场战役牺牲的愤怒。那是他们的同胞，是他们的战友，却没有人在意他们的离开，在世俗的眼光里，他们的死亡理所当然。
2041年5月5日，一艘前往中国的轮船惨遭深海袭击，人员死伤大半，护舰舰娘战亡。
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